合肥院全面实施“人才强企”战略，在控制人员总量的前提下，以提高员工素质为主导，优化企业的人力资源配置，盘活现有人力资源。实现人力资源“规模适当、结构合理、机制创新、素质优良、管理规范、环境优化”的目标。即人力资源供给与企业发展需求基本适应，人力资源配置科学、用人机制合理和分配机制科学灵活，绩效管理取得成效，员工激励与培训开发有效结合充分，提高员工整体素质，现代人力资源管理理念基本确立，人才成长的环境进一步优化，人力资源开发与管理步入良性发展轨道。努力吸引和培养高素质的经营、管理、技术、营销和具有综合素质的各类复合型人才，营造良好的用人机制，合理调整人力资源结构，建立和完善薪酬管理体系和绩效管理体系，充分调动员工的积极性和创造性。
合肥院（包括分子公司）现有职工1362人，其中享受政府特殊津贴人员4人，拥有教授级高级工程师94人，高级工程师188人，工程师254人，博士后1人，博士7人，硕士217人，本科学历以上人员占总人数58%以上。